公积金贷款和商业贷款在多个方面存在显著的差异，以下是具体的对比分析：

一、贷款条件

公积金贷款：需按照各地政策缴满一定期限的公积金才能申请公积金贷款。此外，公积金贷款额度有限制，最高不能超过借款人退休年龄内所缴纳的住房公积金数额的两倍。

商业贷款：对于未缴纳公积金或缴存不足的购房者更具包容性，没有硬性规定必须缴纳公积金。贷款额度灵活，企业可以根据自身资金需求申请不同额度的贷款。

二、贷款流程

公积金贷款：流程相对繁琐，需待过户取得房产证并完成抵押登记后才可放款，整个过程通常耗时两月左右。

商业贷款：以其高效著称，最快可在房屋过户当天完成放款，常规情况下一般不超过15个工作日。

三、利率

公积金贷款：利率大大低于同期商业贷款。例如，5年以上期限的公积金贷款利率常为4.25%，而商业贷款的基准利率通常高于公积金贷款，如6.15%。

商业贷款：利率市场化，根据市场利率水平和企业信用状况进行调整，具有一定的灵活性。

四、贷款期限

公积金贷款：国家规定贷款期限是一至三十年，银行一般要求借款人采取先付息、后还本的等额还款方式还本付息。

商业贷款：期限可以根据企业的实际需求进行选择，短期、中长期等不同期限的贷款都可以满足企业的需求。

五、还款方式

公积金贷款：借款后如提前还款，可以选择部分或全部，不需要预约。部分还款后可以选择缩短还款年限、还款额不变，还款年限不变、还款额减少，延长还款年限、还款额增加等还款方式。此外，可以用住房公积金逐月还贷和在一次还清时用住房公积金冲贷。

商业贷款：还款方式可能因银行而异，但一般也包括等额本息、等额本金等多种方式。

六、抵押关系

公积金贷款：借款人将房产抵押给住房担保中心，后者作为担保方介入抵押关系。

商业贷款：借款人直接将所购房产抵押给贷款银行，形成借款人与放贷银行间的抵押关系。

综上所述，公积金贷款和商业贷款各有优缺点，具体选择哪种贷款方式应根据借款人的实际情况和需求来决定。